Avaliação in sílico de fármacos diuréticos reposicionados como inibidor de proteínas do Sars-Cov-2.

Abstract

RESUMO Em dezembro de 2019, surgiu na China o novo coronavírus (Sars-Cov-2) e se espalhou rapidamente por todo o planeta causando uma pandemia e, conseguintemente, milhares de mortes. Apesar do grande esforço da ciência ainda não existem fármacos comprovadamente eficazes contra a Covid-19, sendo necessário estudos que venham a agregar esta possibilidade visto a permanência do vírus em nossa sociedade. Diante disso, a presente pesquisa realizou uma avaliação in sílico de fármacos diuréticos reposicionados por docagem molecular como inibidor de proteínas do coronavírus Sars-Cov-2. A metodologia utilizada para esta pesquisa constituiu-se de buscas em bancos de dados de produções científicas para uma prospecção dos diuréticos. As docagens realizadas com os diuréticos e as proteínas do vírus foram feitas no programa AutoDock e Vina, posteriormente, os arquivos de proteínas foram preparados pela remoção de todas as moléculas de água e outros grupos, como íons, usando o software Chimera. Os resultados obtidos a partir da interação dos diuréticos com a proteína Spike, revelaram que o Metolazone apresentou a maior afinidade molecular, com energia de ligação de -7.37 kcal/mol-1 ; com a proteína Spike o Torseomide apresentou energia de ligação de -7.25 kcal/mol1 , revelando-se como a maior afinidade; também com a proteína spike, o Bendroflumethiazide demonstrou a maior afinidade molecular, com energia de ligação de -6.18 kcal/mol-1 e a Espirolactona apresentou energia de ligação de -8.1 kcal/mol-1 ; com a ECA2 o Bendrolumethiazide teve a maior afinidade, com energia de ligação de -7.0 kcal/mol-1 ; já com o complexo ECA2/Spike o diurético de maior afinidade foi o Chlorthalidone, com energia de ligação de -7.1 kcal/mol-1 e por fim, a interação dos diuréticos com a proteína mPRO demonstrou que a Espirolactona mais uma vez apresentou maior afinidade molecular, com energia de ligação com valor de -7.4 kcal/mol-1 . Assim, podemos propor que os diuréticos Bendroflumethiazide e o Espirolactona podem ser bons candidatos ao reposicionamento de fármacos no combate ao coronavírus.___ABSTRACT In December 2019, the new coronavirus (Sars-Cov-2) emerged in China and spread rapidly across the planet, causing a pandemic and, consequently, thousands of deaths. Therefore, the present research carried out an in silico evaluation of diuretic and anticoagulant drugs repositioned by molecular docking as an inhibitor of the S-binding protein in the ACEII cell receptor of the Sars-Cov-2 coronavirus. The methodology used for this research consisted of searches in databases of scientific productions for a scientific prospection of diuretics. Dockings performed with the diuretics and virus proteins were performed in the AutoDock program and, later, the protein files were prepared by removing all water molecules and other groups, such as ions, using the Chimera software. The results obtained from the interaction of diuretics with the Spike protein revealed that Metolazone had the highest molecular affinity, with binding energy of -7.37 kcal/mol-1 .With the 6VYB protein, Torsemide presented binding energy of 7.25 kcal/mol-1 , revealing itself as the highest affinity. With the 6VYB protein with site 2 coordinates, Bendroflumethiazide demonstrated the highest molecular affinity, with binding energy of -6.18 kcal/mol-1 . With the spike protein with site 2, Spirolactone showed binding energy of -8.1 kcal/mol-1 , the highest being presented. With ACE2, Bendrolumethiazide had the highest affinity, with binding energy of -7.0 kcal/mol-1 . With the ACE2/Spike complex, the diuretic with the highest affinity was Chlorthalidone, with a binding energy of -7.1 kcal/mol-1 And finally, the interaction of the diuretics with the mPRO protein showed that Spirolactone once again showed greater affinity molecular, with binding energy of -7.4 kcal/mol-1 . Thus, we can propose that the diuretics Bendroflumethiazide and Spirolactone may be good candidates for drug replacement in the fight against coronavirus.