Reposicionamento de fármacos antiparasitários para a covid-19: um estudo in sílico

Abstract

RESUMO: Desde que se transformou em uma pandemia, o coronavírus (COVID-19) tem ocasionado diversos impactos negativos a população mundial. A disseminação do vírus já infectou e levou à óbito milhares de pessoas no mundo. Diante disso, essa pesquisa visa realizar um estudo in sílico de drogas antiparasitárias por afinidade molecular com potencial ação antiviral contra a Covid-19. Em virtude disso, foram desenvolvidas docagens moleculares com o intuído de averiguar a afinidade molecular de fármacos antiparasitários com proteínas do coronavírus. Foram analisadas a afinidade molecular de 12 antiparasitários sendo eles, albendazol, cambendazol, levamisol, mebendazol, metronidazol, nitazoxanida, praziquantel, ivermectina, niclosamide, oxamniquine, benznidazol e tiabendazol com as proteínas Spike, ECA 2 (Enzima conversora de angiotensina 2), Spike/ECA e mPRO (proteína principal) do coronavírus. A metodologia utilizada para a realização da pesquisa foi feita através de busca de dados de produções científicas em bases de dados nacionais e internacionais para uma prospecção científica dos antiparasitários. Para as docagens, inicialmente as proteínas e os ligantes foram preparados com a remoção de todos as moléculas de água e outros grupos, como íons usando o software Chimera e, em seguida, as docagens entre ambos foram realizadas utilizando os programas AutoDock Tools e AutoDock Vina. Os resultados demonstram que a ivermectina, apresentou a melhor afinidade molecular com a proteína spike com energia de ligação de -9.3 kcal/mol 1 . Com a proteína ECA 2 a ivermectina também obteve melhor afinidade com energia de -8.4 kcal/mol 1 . Já com o acoplamento da proteína ECA 2 com a proteína Spike, o antiparasitário praziquantel obteve melhor interação com energia de -8.1 kcal/mol 1 . Com a proteína mPRO a melhor afinidade molecular se deu também com o praziquantel com energia de -7.5 kcal/mol 1 . Podemos sugerir que o antiparasitário praziquantel apresenta potencial contra a covid-19 segundo os métodos analisados, uma vez que esse fármaco apresentou resultados promissores para a inibição do vírus. No entanto, outros testes como dinâmica molecular, in vitro, in vivo e testes clínicos precisam ser realizados para a confirmação dos dados.__ABSTRACT: Since becoming a pandemic, the coronavirus (COVID-19) has caused several negative impacts around the world. The spread of the virus has already infected and led to the death of thousands of people across the world. From this, this research aims to carry out a study on silica of antiparasitic drugs by molecular affinity with potential antiviral action against Covid-19. As a result, molecular drugs were developed to determine the molecular formula of antiparasitic drugs. They showed the same molecular similarity of 12 antiparasitic drugs, namely, albendazole, cambendazole, levamisole, mebendazole, metronidazole, nitazoxanide, praziquantel, niclosamide, oxamniquine, benznidazole and thiabendazole with the names Spike, ECA 2 (Angiotensin 2 Enzyme), Spike/ECA and mPRO (main protein) of the coronavirus. The methodology used to search for the research was carried out by scientists in national and international databases for the scientific prospection of antiparasitics. Initially, proteins and ligands were prepared by removing all such as water docks and other groups used as docks such as proteins and other used groups, then using AutoDock Tools and AutoDock Vision programs. The results with binding energy of -9kcal/mol1. With ACE 2 to 8 the protein also improves with Kmol.4 energy energy. With the interaction of the ACE 2 protein with a Spike protein, the best antiparasitic interaction was obtained with an energy of -8.1 kcal/mol-1. With an mPRO protein, the best molecular k also occurred at an energy of -7.5/mol-1. It is suggested that praziquantel has potential against the covid-19 method according to the methods, as this drug showed promising results for the We can produce virus. However, other dynamic molecular tests in vitro, in vivo, and clinical trials were performed to confirm the result.