ESTRUTURAÇÃO DE UMA BASE DE DADOS DE EXPRESSÃO GÊNICA PARA ANÁLISE IN SILICO DE GENES ASSOCIADOS À TUBERCULOSE

Abstract

Entender e combater a tuberculose tem sido, por décadas, o objetivo de grande parcela da comunidade científica, tendo em vista seu potencial patogênico e o grande número de óbitos causados pelo Mycobacterium tuberculosis. Eventualmente, as ciências biológicas ganharam um grande aliado no processo de entendimento de doenças e microrganismos: a transcriptômica. Esse segmento da biologia molecular permite um estudo mais aprofundado e detalhado do comportamento transcricional de seres vivos, compilando seus dados experimentais em extensas bases de dados. Nesse cenário, o objetivo do presente trabalho foi estruturar uma base de dados com informações referentes ao perfil de transcrição gênica de macrófagos no contexto da tuberculose. Além disso, foi delimitado o estudo do padrão de expressão gênica da via IL-18/SIGIRR na tuberculose, tendo em vista seu potencial como via importante no combate ao M. tuberculosis. O processo de estruturação da base de dados consistiu, inicialmente, na elaboração de vias de sinalização no STRING e inBio Discover que forneceram, respectivamente, 54 e 26 genes. Após serem colocados em um diagrama de Venn, os 19 genes presentes simultaneamente nas duas bases de dados foram selecionados para direcionarem a análise de DEGs, que resultou na elaboração de tabelas com padrão de regulação e heatmaps. Em relação aos genes da via IL- 18/SIGIRR, os genes IL18, IRAK2 e IRF7 estavam regulados positivamente (expressão aumentada), indicando um padrão de resposta reativo ao M. tuberculosis, bem como está documentado na literatura. O gene SIGIRR apresentou um padrão de expressão inconclusivo e faz-se necessário analisar outros datasets para o estabelecimento de seu padrão transcricional. Sendo assim, o presente estudo demonstrou todo o processo de tratamento e normalização de dados de expressão gênica, provando ser possível trabalhar com informações de transcriptômica em contextos mais objetivos de estudo, visando uma via de sinalização ou proteína específica. Ainda, este trabalho sinaliza a possibilidade de pesquisas em condições de orçamento modesto e sem grandes instalações laboratoriais, além de incentivar a reutilização eficiente de grandes volumes de dados compilados, que seriam apenas armazenados e agora podem ser empregados em análises de grande valor científico.