Estudo in silico com o processo de docagem molecular do potencial farmacológico da Moringa oleifera Lam. moringaceae contra os alvos do sars-cov-2

Abstract

RESUMO:Em dezembro de 2019 uma nova doença respiratória foi identificada em Wuham na China. Essa doença, é causada pelo novo coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV2), este agente etiológico possui alta taxa de contagio e é responsável pelo surto da pneumonia viral aguda. Nos últimos anos tem-se ampliado o uso de plantas medicinais no tratamento de diversas enfermidades, isso porque, vem ganhando grande credibilidade em decorrência das importantes pesquisas farmacêuticas. Este estudo teve como objetivo identificar potenciais compostos antivirais da Moringa oleifera Lam. contra o SARS-COV-2. Na metodologia utilizada foi realizada a seleção dos constituintes químicos das folhas, flores, frutos e sementes da M. oleifera adquiridas na base de dados Pubchem e a retirada das proteínas do SARS-COV2 (6VXX, 6LU7, 1R42) do banco de dados do Protein Data Bank (PDB). As docagens foram realizadas utilizando o programa Autodock Tools 1.5.6, e o Autodock Vina na obtenção do cálculo, foi usado o LigPlus na obtenção dos aminoácidos, e o software Chimera v.13.1para a obtenção das estruturas em 3D. Foram realizadas no total 244 docagens moleculares, testando 61 ligantes com quatro receptores do SARS-COV-2. Sendo considerados os melhores resultados os que obtiveram energia de ligação menores que -7.9 kcal.mol-¹, com um total de 22 moléculas, visto que os três melhores resultados foram os compostos ácido elágico com energia de -9.3 kcal.mol-¹, rutina -9.1 kcal.mol-¹, miricetina -9.1 kcal.mol-¹, em interação com a proteína Spike. Compostos como o ácido elágico, rutina e a miricetina demonstraram resultados satisfatório de inibição de alvos do SARS-COV-2, e os promissores fármacos contra a doença COVID-19. No entanto, a realização de outros estudos como in vitro, in vivo e testes clínicos são necessários para a confirmação da atividade antiviral desses compostos.___ABSTRACT; In December 2019 a new respiratory disease was identified in Wuham in China. This disease is caused by the new severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), this etiological agent has a high contagion rate and is responsible for the outbreak of acute viral pneumonia. In recent years, the use of medicinal plants in the treatment of various diseases has increased, because they have gained great credibility as a result of important pharmaceutical research. This study aimed to identify potential antiviral compounds from Moringa oleifera Lam. against SARS-COV-2. In the methodology used, the selection of the chemical constituents of the leaves, flowers, fruits and seeds of M. oleifera acquired in the Pubchem database and the withdrawal of the SARS-COV-2 proteins (6VXX, 6LU7, 1R42) from the database from the Protein Data Bank (PDB). The dockings were performed using the Autodock Tools 1.5.6 program, and Autodock Vina to obtain the calculation, LigPlus was used to obtain the amino acids, and the Chimera v.13.1 software to obtain the 3D structures. A total of 244 molecular dockings were performed, testing 61 ligands with four SARS-COV-2 receptors. Considering the best results those who obtained binding energy lower than -7.9 kcal.mol-¹, with a total of 22 molecules, since the three best results were the ellagic acid compounds with energy of -9.3 kcal.mol-¹, rutin -9.1 kcal.mol-¹, myricetin -9.1 kcal.mol-¹, in interaction with the Spike protein. Compounds such as ellagic acid, rutin and myricetin have shown satisfactory results in inhibiting SARS-COV-2 targets, and promising drugs against the COVID-19 disease. However, further studies such as in vitro, in vivo and clinical tests are necessary to confirm the antiviral activity of these compounds.