Avaliação in silico da interação entre proteínas estruturais do sars-cov-2 e drogas propagadas como opções para tratamento da covid-19

Abstract

RESUMO: A pandemia por COVID-19, provocada pelo novo coronavírus SARS-CoV-2 já ultrapassa os 490 milhões de casos, com mais de seis milhões de óbitos provocados. Recentemente, houve um grande avanço no desenvolvimento de vacinas para SARS-CoV-2, não obstante, ainda não há nenhum medicamento que seja oficialmente aprovado e recomendado como terapêutica para a pandemia atual ou para as demais doenças provocadas por coronavírus. A realocação de fármacos já existentes se torna uma possibilidade atrativa ao diminuir o orçamento e o tempo despendido, todavia, muitos fármacos foram indevidamente veiculados à mídia como possibilidades terapêuticas para COVID-19. Para encontrar uma terapêutica viável, é necessário conhecer o patógeno. O SARS-CoV-2 codifica 27 proteínas, das quais quatro delas são as chamadas proteínas estruturais, que abrange as proteínas de pico, nucleocapsídeo, membrana e envelope, associadas às funções de reconhecimento, montagem e liberação da partícula viral. Tendo isso em mente, objetivo dessa pesquisa é verificar a existência de interações in silico entre as proteínas estruturais do SARS-CoV-2 e os fármacos divulgados como opções terapêuticas para a COVID-19, por meio da realização de testes de docagem molecular realizados na plataforma DockThor-VS. Os fármacos que se destacaram com os melhores resultados de afinidade com os sítios de ligação dentre os testados foram: ivermectina, remdesivir, azitromicina e dexametasona.___ABSTRACT The Covid-19 pandemic, caused by the new coronavirus SARS-CoV-2, exceed 490 million cases, with over 6 million deaths confirmed. Recently, there has been a substantial advancement in the development of vaccines for SARS-CoV-2. Nevertheless, there are no drugs officially approved and recommended as a therapeutic approach for the current pandemic or the other diseases caused by coronaviruses. The relocation of existing drugs is an interesting possibility, since it reduces the expenses and saves time. However, a significant number of drugs were divulged on the media as a therapeutic option for COVID-19. In order to develop a viable therapeutic approach, it is essential to know the pathogen. The SARS-CoV-2 encodes 27 proteins, which four are structural proteins (spike, nucleocapsid, membrane and envelope proteins). These proteins are responsible for recognition, assembly and liberation of the viral particle. Therefore, this article aims to verify the interaction in silico between SARS-CoV-2 structural proteins and the drugs divulged as therapeutic options for COVID-9. The interactions were assessed by molecular docking, using the DockThor-VS platform. Ivermectin, remdesivir, azithromycin and dexamethasone showed the best results in affinity tests.