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http://hdl.handle.net/123456789/8888
Título: | Estudo In sílico da composição química do Stryphnodendron Adstringens no bloqueio a replicação viral do SARS-COV-2 |
Título(s) alternativo(s): | In silico study of the chemical composition of Stryphnodendron Adstringens in blocking SARS-COV-2 viral replication |
Autor(es): | FARIAS, Sara Regina Costa |
Palavras-chave: | Plantas medicinal; estudo in sílico; SARS-CoV-2. Medicinal plants; in silico study; SARS-CoV-2. |
Data do documento: | 19-Jan-2025 |
Editor: | Universidade Federal do Maranhão |
Resumo: | RESUMO Neste estudo 22 compostos foram utilizados da Stryphnodendron adstringens é uma espécie do cerrado brasileiro de alta demanda farmacêutica devido à produção potencial de tanino, conhecida popularmente como barbatimão, é utilizado para o tratamento de leucorreia, diarreia, hemorragia, hemorroida, feridas, conjuntivite, inflamação de garganta, corrimento vaginal e ulcera gástrica. Esse estudo tem o objetivo de realizar um estudo in sílico dos constituintes químicos do Stryphnodendron adstringens para inibição das proteínas de replicação celular do novo coronavírus SARS-CoV-2. Esse estudo tem afinidade de fazer analises computacionais utilizado compostos se têm forte, afinidade com a proteína Spike. Dado que Emodin, Leucoantocianidinas, Procianidina B1, Prodelfinidinas e Rutin foram testados, os valores de energia de ligação apresentaram-se entre -8,1 e -9.1. Esses valores indicam que os compostos têm uma forte afinidade com a proteína Spike, o que sugere que eles podem ser eficazes na inibição da replicação celular do vírus SARS-CoV-2. No estudo foi utilizado a docagem molecular, com as estruturas em 3D dos alvos de coronavírus foram obtidos no banco de dados de proteínas PDB com os respetivos códigos. As docagens serão realizadas utilizando o programa Autodock Tools. O receptor será considerado rígido, enquanto cada ligante foi considerado flexível. As cargas parciais. Serão calculadas após a adição de todos os hidrogênios. Os átomos de hidrogênio não polares de proteínas e ligantes serão subsequentemente mesclados. Nessa análise foi feita com base nessa metodologia, seleção dos ligantes de S. adstringens pretende-se selecionar drogas de várias classes oriundas da espécie S. adstringens como flavonoides, alcaloides, terpenoides, cumarinas, saponinas entre outras. As estruturas serão desenhadas ou adquiridas nas bases de dados. Foi feita a Predição ADME-TOX Incluindo ensaios de carcinogenicidade e teste de ames. Entre outros parâmetros de absorção como a capacidade da droga de atravessar a barreira do cérebro (BBB), bem como a taxa de absorção da droga (Caco2), a taxa de absorção por células intestinais humanas (HIA) e excreção (MDCK). Em relação ao processo de metabolização, a capacidade de inibição, não inibição e formação de substrato pelas moléculas através seu comportamento. |
Descrição: | ABSTRACT In this study, 22 compounds were used from Stryphnodendron adstringens, a species from the Brazilian cerrado with high pharmaceutical demand due to the potential production of tannin, popularly known as barbatimão, it is used for the treatment of leucorrhoea, diarrhea, hemorrhage, hemorrhoids, wounds, conjunctivitis, inflammation throat, vaginal discharge and gastric ulcer. This study aims to carry out an in silico study of the chemical constituents of Stryphnodendron astringens to inhibit the cellular replication proteins of the new SARS-CoV- 2 coronavirus. This study aims to carry out computational analyzes using compounds that have a strong affinity with the Spike protein. Since Emodin, Leucoanthocyanidins, Procyanidin B1, Prodelphinidins and Rutin were tested, the binding energy values were between -8.1 and -9.1. These values indicate that the compounds have a strong affinity for the Spike protein, which suggests that they may be effective in inhibiting cellular replication of the SARS-CoV-2 virus. In the study, molecular docking was used, with the 3D structures of the coronavirus targets being obtained from the PDB protein database with the respective codes. Docking will be carried out using the Autodock Tools program. The receptor will be considered rigid, while each ligand will be considered flexible. Partial loads. They will be calculated after adding all hydrogens. The non-polar hydrogen atoms of proteins and ligands will subsequently be merged. In this analysis, based on this methodology, the selection of S. adstringens ligands was carried out. The aim is to select drugs from various classes originating from the S. adstringens species, such as flavonoids, alkaloids, terpenoids, coumarins, saponins, among others. The structures will be designed or acquired from databases. The ADME-TOX Prediction was made, including carcinogenicity tests and ame test. Among other absorption parameters such as the drug's ability to cross the brain barrier (BBB), as well as the rate of drug absorption (Caco2), the rate of absorption by human intestinal cells (HIA) and excretion (MDCK). In relation to the metabolization process, the capacity for inhibition, non-inhibition and substrate formation by molecules through their behavior. |
URI: | http://hdl.handle.net/123456789/8888 |
Aparece nas coleções: | TCC de Graduação em Ciências Naturais/Química do Campus de São Bernardo. |
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